头孢拉定是一种头孢类抗生素，副作用比较多，可以累及各个系统，发生率为6%，其中以消化道症状最为常见。比如恶心、呕吐、腹泻、腹痛、上腹部不适以及食欲减低等较为常见。其次是药疹、过敏反应，发生率可以达到1%-3%左右。
除此之外，患者还可以出现血液系统的不良反应，比如可以出现嗜酸粒细胞增多、白细胞或者是中性粒细胞减少。还有肾毒性，少数患者还可以出现暂时性的尿素氮升高。肝毒性患者可以出现肝功能不全，转氨酶升高等，还可以出现静脉炎。