指甲凹凸不平，如果是短时间刚刚形成的，有可能是真菌感染导致的。需要进行显微镜检测，看看有没有真菌，如果有真菌阳性，需要进行抗真菌治疗。可以口服伊曲康唑，或者是特比萘芬等等，局部可以使用阿莫罗芬搽剂，1天2次。如果比较肥厚，需要局部使用锉刀，锉去感染过的病甲，再使用阿莫罗芬搽剂。除了真菌感染以外，如果真菌检测是阴性，可能是指甲的甲营养不良症，如果是甲营养不良症，大多是由于甲母质的营养功能出现障碍，可以外涂多磺酸粘多糖乳膏，使用于甲根部的甲母质部位。