念珠菌为条件致病菌，可通过直接或间接接触大量致病念珠菌，而引起念珠菌局部感染，也可在人体免疫能力低下时引起感染。
感染后首先应注意鉴别致病性念珠菌的种类，并注意与细菌、病毒进行区分，以去除各种诱因。对有严重基础性疾病的患者加强治疗，如糖尿病病人控制好血糖；艾滋病患者进行抗病毒治疗；菌群失调应停止或正确使用广谱抗生素或免疫抑制剂。
其次，根据感染的部位不同需采用不同的治疗方案。比如局部感染可采用局部用药，可以用制霉菌素软膏、达克宁软膏、克霉唑软膏等进行局部涂抹；慢性皮肤黏膜念珠菌病可口服酮康唑；口腔念珠菌感染可口服或静脉注射氟康唑；系统感染念珠菌如消化道、呼吸道等，可口服静脉注射伏立康唑和氟康唑等；对于严重念珠菌感染或肾功能不全者，可考虑使用两性霉素B。