左小腿静脉血栓诊断明确后，应尽早进入治疗的程序，主要的治疗方式为抗凝，有时可以加溶栓治疗。
左小腿静脉血栓也会出现血栓脱落，导致肺栓塞的风险，所以病人应绝对卧床，包括大、小便及饮食，均应在床上进行，可以稍稍侧翻身，以防止发生压疮，患肢可适当抬高，以利于回流，使水肿消退。
出现左小腿静脉血栓后，还应进行血栓原因的查找，因血栓5年的复发率接近1/4，如果不查找原因，则血栓复发的风险会更大。