儿童患有高热以后应用灌肠的方法退热，具有以下好处：首先，具有局部给药的良好作用，如果儿童高热由于肠道的细菌性感染引起，这时应用灌肠的方法可以直达病所，从而见效非常迅速。其次，避免服药的困难，儿童对于药物大多服用比较困难尤其婴幼儿，应用灌肠的方法有效避免这种困难。
高热灌肠也会有一定的坏处：首先，会引起儿童出现腹胀、腹痛。如果灌肠的压力没有控制好，会引起儿童出现腹痛、腹胀。其次，会干扰儿童的肠道菌群，部分药物灌肠以后，往往会干扰正常的肠道菌群，引起肠道菌群的紊乱。