肺结核的痰液检查阳性率是较低的，不是每次做痰培养均可以查到结核杆菌。但如果患者出现典型的临床表现以及影像学改变，可以临床确诊为肺结核，例如患者出现低热、乏力、盗汗、消瘦等结核中毒症状。
同时出现呼吸道的症状，例如咳嗽、咳痰、胸痛、咳血和呼吸困难，胸片或者是肺CT提示的结核病灶，多位于双肺上叶，患者的血沉出现增快，PPD强阳性，考虑肺结核。
可试验性的使用抗结核的药物，例如异烟肼、利福平、吡嗪酰胺、链霉素等等，并多次留痰查抗酸杆菌。