甲状腺的指标主要包括甲状腺激素、甲状腺抗体以及甲状腺超声的一些指标，甲状腺激素的指标主要包括总T3、总T4、游离T3、游离T4，以及调节甲状腺激素的促甲状腺激素TSH，是由垂体分泌。
甲状腺的一些抗体包括甲状腺球蛋白抗体、甲状腺微粒体抗体、促甲状腺激素受体抗体，甲状腺的抗体升高多发生于弥漫性甲状腺肿伴甲状腺功能亢进症，以及桥本氏甲状腺炎。
还有一些甲状腺的指标就是包括甲状腺的超声，甲状腺超声对甲状腺有具体的描述，并有分级，甲状腺结节的分级是从0-Ⅴ级有六个分期，以检查甲状腺是否发生结节、恶性病变、肿瘤。
综合分析需要包括甲状腺的临床症状、体征、实验室检查，综合判断患者发生哪一类疾病。