腱鞘囊肿常常发生在手部，尤其是手背和手指以及足背。腱鞘囊肿是囊性的肿物，是由囊壁和囊肿内的积液形成的囊性肿物，一般边界比较清楚、表面比较光滑、张力大、按压感觉比较硬。
需要与腱鞘囊肿鉴别的疾病并不多，如果是发生在手指应该与腱鞘巨细胞瘤鉴别，腱鞘巨细胞瘤是实性肿物，边界不如腱鞘囊肿清楚，张力也比腱鞘囊肿要小，按压比较软，而且表面不光滑，经常会有结节样的感觉。而且腱鞘巨细胞瘤经常发生在手指的掌侧或者是背侧，这些位置不是腱鞘囊肿的好发部位。
手背的腱鞘囊肿应该与手背的肌腱滑膜炎症相鉴别，肌腱的滑膜炎症表现为手背的弥漫性肿胀，按压比较软，没有明显的发硬包块，常常会引起局部的疼痛，而腱鞘囊肿是基本不疼的，做B超可以明确的区分囊肿、实性肿物或者是滑膜炎。