新鲜尿液具有特殊微弱的气味，略有氨味。食用辣椒或蒜后，尿中会带臭味，不同尿液的气味常常反映不同的疾病，如特殊的水果味，常常见于糖尿病酮症。特殊的臭味，见于苯丙酮尿症。
新鲜尿既有腐败性臭味，常见于泌尿道细菌感染。如果尿液出现苹果香味，常常见于糖尿病酸中毒或饥饿时出现酮尿症。粪臭类尿味常常提示膀胱结肠瘘，病人尿里常常带有粪臭味。