莲花清瘟的功效主要用于治疗流行性、病毒性感冒引起的高热、头痛、咽痛、肌肉酸痛，以及鼻塞、流涕、咳嗽等症状，对流感病毒以及新冠肺炎病毒有作用。
具体服用方法为胶囊剂，一次四粒且一日三次，颗粒剂一次一包，温开水冲服一天三次，服药期间不要吃辛辣、刺激性食物，以及油腻、生冷食物，戒烟、酒，服药期间多喝水。
风寒感冒者不宜使用连花清瘟，孕妇、哺乳期妇女以及体弱患者使用时需注意不良反应。