脑积水手术主要有两大类，最常用的是脑室-腹腔分流术，可以用于治疗各种类型的脑积水，包括梗阻性脑积水，交通性脑积水，正常压力性脑积水以及其他分流手术失败的脑积水。在手术之后，患者可能出现的后遗症：
第一、主要包括分流管堵塞，可以是分流管的阀门堵塞，也可以是脑室端或者腹腔端的堵塞；
第二、感染，包括脑室炎、脑膜炎、腹膜炎、膈下脓肿、腹腔脓肿等；
第三、颅内出血；
第四、分流过度致低颅压；
第五、消化道症状；
第六、分流管脱出。
另外一种治疗方法是神经内镜治疗，主要有治疗之后发生脑内、脑室内出血以及脑积水再次形成等后遗症。