刚开始戒烟出现咳嗽的症状，一般考虑是出现了戒断综合征。戒断综合征是因为存在对烟草的严重依赖，尤其是对尼古丁的依赖，长期吸烟者可以对气道的黏膜造成慢性损伤，比如导致肺部纤毛的损伤以及腺体分泌增加。
重度烟草依赖者戒烟后，由于气道失去了烟草的刺激，气道内的腺体以及黏膜逐渐开始修复，而在修复的过程中，气道黏膜上皮细胞更新，部分上皮细胞脱落、坏死，并逐渐增多，因而刺激气道类的咳嗽感受器产生咳嗽的动作，但随着戒烟的逐渐深入，气道黏膜功能逐渐修复，咳嗽症状又会逐渐减轻和消失。因此，刚开始戒烟出现咳嗽并不需要进行特殊的处理，因为这是一种正常的防御性反射，通过咳嗽排出气道内的坏死物质，所以戒烟贵在坚持。