细菌性心肌炎和病毒性心肌炎的区别，一般考虑以下几种：
一、感染的病原微生物不同：细菌性心肌炎是由于细菌感染所导致，病毒性心肌炎是由于病毒感染所导致，也就是两者所感染的病原微生物不同。
二、治疗方式不同：细菌性心肌炎的发生率比较小，但是可以通过抗生素来进行治疗，也就是选择能够对抗患者所感染细菌，且特别有针对性、特别敏感的抗生素进行治疗，患者体内的细菌会大量的减少。也就是是否应用抗生素，对于患者细菌感染的疗程有很大的影响。不用抗生素治疗，患者的细菌感染疗程会非常漫长，甚至很多时候会导致患者心肌炎加重，随时导致患者出现生命危险。如果用敏感的抗生素治疗，患者的疗程会大大缩短，患者的病情也会大大减轻。病毒性心肌炎并不是这样，病毒性心肌炎主要是靠自限性，也就是一旦患者感染病毒，应用抗病毒的药物治疗，对于病毒来说效果并不理想，更多的是靠病毒自限，也就是正常的病毒在人体当中一段时间内就会自动消亡，主要要做的就是营养心肌，让患者挺过病毒自限的这个时间段。