睑板腺囊肿，通常考虑到医院里进行手术治疗，睑板腺囊肿是一种非炎症性的疾病，早期是无意当中发现眼皮上出现小包块，开始包块可能比较小，暂时不用处理。有些患者可能会并发感染，出现类似于麦粒肿的症状，需要进行局部抗炎治疗，睑板腺囊肿比较小，有些患者能够自行好转。
对于比较明显的囊肿，考虑到医院眼科门诊进行手术摘除，否则不处理，有可能会导致囊肿的囊壁破裂引起肉芽肿。对于老年患者，反复出现睑板腺囊肿表现，需要将手术摘除的组织进行病理切片检查，防止睑板腺癌的可能。