2019年的12月12日武汉市卫生健康委员会报告了27例人类病毒性肺炎的病例，其中有七例是比较病重的病人，所有的患者都有华南海鲜批发市场的暴露史，可见新型冠状病毒最初感染的地点可能是在武汉华南海鲜市场。
2020年的1月7日我国研究者分离出了新型冠状病毒的毒株，并对它进行了基因测序，并命名为新型冠状病毒，因此认为第一例的新型冠状病毒感染者是我国从2019年的12月12日所发现。考虑这种病毒的出现可能是有一种自然的中间宿主，但是武汉华南海鲜市场出售的动物可能促进了该病毒在人体内出现。目前的结论是新型冠状病毒可能是从一种未知的野生动物传染到人，又在人与人之间进行传播，这可能是新型冠状病毒传染的病因。