切除甲状腺主要是针对甲状腺腺瘤或甲状腺囊肿体积较大，产生压迫症状，如声音嘶哑、饮水呛咳、吞咽困难或呼吸困难等，甲状腺结节体积较大、增长迅速、钙化明显或周边界限不清，有恶变的可能，以及甲状腺癌。
对于切除甲状腺后所需要的服药主要包括，如伤口有炎症或者感染的倾向时，可服用头孢类的抗生素或者阿莫西林胶囊等，行抗感染的治疗。
如因为甲状腺癌行甲状腺的全切术，由于缺乏了甲状腺分泌甲状腺素，可造成体内甲状腺素的水平丧失，从而使人体的生长发育、新陈代谢等发生障碍，产生甲减的症状，此时需要口服甲状腺素片或左旋甲状腺素片加以治疗，以维持人体内正常甲状腺素的水平，防止产生甲减。