消化道包括口腔、食道、胃、小肠、结肠以及肛门的整个结构，不同的部位都可以发生畸形，所以治疗方法是不一样的。
比较常见的是食道可以出现食管重复畸形、食管气管瘘、食管裂孔疝等病变，大部分都需要手术来进行矫正。
胃部可以出现胃重复畸形、幽门梗阻，十二指肠的病变的也可以出现重复畸形，这些重复畸形大部分需要手术治疗。
结肠可以出现先天性巨结肠，也是通过手术才能解决的。
所以大部分的消化道畸形都需要手术解决，需要手术干预来切除病变，恢复消化道正常结构以避免影响孩子正常的生长发育。
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