甲功六项检查包括游离甲状腺素、游离三碘甲状原氨酸、促甲状腺素、甲状腺球蛋白抗体、甲状腺球蛋白，以及甲状腺过氧化物酶抗体。临床上甲状腺疾病就是根据甲功六项的检查指标来确诊的，具体见于以下方面：
1、游离甲状腺素反映甲状腺激素活性的指标。
2、游离三碘甲状原氨酸主要诊断甲状腺功能正常与否，最能反映患者是否有甲状腺功能亢进。
3、促甲状腺素主要反映垂体内促甲状腺激素分泌是否异常。
4、甲状腺球蛋白抗体阳性多见于桥本甲状腺炎。
5、甲状腺球蛋白若降低时，可考虑甲亢、肾病、肿瘤。若甲状腺球蛋白上升时，则肝脏有异常。
6、自身免疫系统有问题时，多甲状腺过氧化物酶抗体升高。