黄体萎缩不全一般不会自愈。黄体萎缩不全主要表现为子宫内膜的不规则脱落，月经周期中有卵泡发育、排卵，黄体发育良好，但是萎缩的过程延长，使子宫内膜不规则脱落，由于下丘脑-垂体-卵巢轴功能调节紊乱，或者由黄体机制异常而引起黄体萎缩不全，内膜持续受孕激素的影响，以至于不能完全的如期脱落，这种情况多数患者不能自愈，需要在诊断明确以后，进行药物的治疗。
黄体萎缩不全的临床症状表现为月经周期正常，但经期延长，甚至可以达到9-10天以上，出血量或多或少，甚至会淋漓数日，才能干净。对于黄体功能不全导致的黄体萎缩，一般选择孕激素进行后半周期的治疗，也可以选择补充孕激素或者口服避孕药等进行全周期疗法，具体选择何种药物，需要遵医嘱，根据医生所推荐的使用方法，来进行规范的治疗。