腱鞘囊肿大部分发生在足背和手背，是足背或者手背内的关节面、关节间隙中的润滑液，从背侧的薄弱的关节囊渗透到皮下形成的囊性肿物。
手术切除主要是把囊肿切除，同时进行关节囊薄弱区的加强缝合。一般手背囊肿要在臂丛麻醉下进行，可以在上臂上止血带，保证囊肿切除的视野没有出血，视野干净囊肿就容易完整剥除，对于关节炎的修复效果也比较好。足背的囊肿最好在腰部麻醉下进行，在大腿近段上气囊止血带，控制视野的清晰。
腱鞘囊肿完全切除后，要常规送病理检查，通过病理诊断确定腱鞘囊肿的诊断没有错误。一般腱鞘囊肿不会恶变，但切下来的肿物都需要进行病理检查。