目前对于沙眼衣原体的检查主要有五种方法，具体如下：
第一、血清学检查：主要是通过检测血液中的抗沙眼衣原体感染病毒抗体来诊断，但是这种检查比较片面，不能通过一次的阳性就可以诊断。
第二、组织培养检查：用免疫荧光法进行鉴别可以确认。
第三、抗原检测方法：如用PCR检测破损处的沙眼衣原体DNA，敏感性和特异性都比较高，但是费用比较昂贵，而且容易出现假阳性。
第四、细胞学检查：用细胞做涂片加荧光标记，进行单克隆抗体的检查。
第五、细胞学诊断检查：需要取病损处的细胞做涂片，然后做染色检查。