乙肝表面抗体低有以下几个原因：
1、日常生活中和乙肝携带者密切接触，正因为不断的接触乙肝病毒，机体就会通过乙肝抗体来中和乙肝病毒，就能够消耗体内的抗体，所以就会出现抗体数值下降。
2、细胞免疫功能不够健全，尤其见于儿童青少年时期，免疫功能还处在发育过程中，不像成年人一样健全，所以给予乙肝疫苗肌注后也只能产生比较小滴度的抗体。
3、身体正处于细胞免疫低下时期，例如最近得了肺结核，或者用了免疫抑制剂如激素、硫唑嘌呤、环磷酰胺等，这时给予乙肝疫苗也无法刺激机体产生足够高的乙肝抗体。
4、有可能是乙肝疫苗本身存在质量问题。乙肝疫苗需要冷链运输，在运输的过程中只要有一个环节温度控制做的不到位，就会导致乙肝疫苗部分失活，所以人体使用之后也无法产生高效价的乙肝抗体。