新生儿肠梗阻的症状表现有呕吐、腹胀，没有排便也不排气，剧烈的哭闹、烦躁不安。因为宝宝不会说腹痛，但是如果成人用手摸腹部，会出现剧烈哭闹。
根据梗阻的部位不同可能表现还有些区别，如果是上消化道梗阻，呕吐就比较频繁，呕吐物常常为进入的乳汁，呈喷射状，腹胀不太明显。如果是下消化道梗阻，腹胀就特别明显，呕吐又不明显，并且呕吐物不担有乳汁，是粪便样的内容物。如果梗阻时间过长，会造成电解质紊乱，患儿表现皮肤干燥、尿少、精神差，还出现酸中毒，甚至个别会造成肠管坏死，引起腹膜炎甚至休克。