排卵后孕激素会兴奋下丘脑体温调节中枢，可使基础体温在排卵后升高0.3-0.5℃，临床上也可以根据这一特点，作为判断排卵日期的标志之一，也就是双相基础体温是体内排卵的一个标志，也提示体内孕激素水平趋于正常的状态。
如果孕激素和雌激素的协同和作用，也就出现周期性的月经来潮，如果女性孕激素不足，会导致月经提前或者怀孕之后也容易发生先兆流产的情况，所以体内孕激素的生理作用是极其重要的。