引起高密度蛋白胆固醇偏低的原因可分为病理性原因以及生理性原因。
病理性原因常见于脑血管病，比如脑梗死、脑出血疾病，还有冠状动脉粥样硬化性心脏病、高甘油三酯血症和肝功能损害，如急慢性肝炎、肝硬化、肝癌等。
生理性原因常见于肥胖、吸烟、长期体力活动不足，大量运动后、以及应激反应等。
高密度蛋白胆固醇偏低，建议饮食中多吃含不饱和脂肪酸高的食物，用橄榄油、芥花油、葵花油、大豆油、玉米油等的植物油取代动物性油脂，有利于低密度脂蛋白胆固醇转化为高密度脂蛋白胆固醇，对人体有很大的益处。