患者出现大肠杆菌疾病，需要在疾病开始的时候采用抗菌的方法来治疗，服用多黏菌素B以及多黏菌素E对肠道进行调理，若病情比较轻则不需要服用抗菌药物。
在临床上，患者首选服用诺氟沙星进行治疗，也可以口服庆大霉素，或者用妥布霉素进行肌肉注射，这些都能达到治疗效果。
除了西药治疗以外，患者还可以采用中药的方式来进行诊治，可以用白头翁、黄连以及黄柏等中药，用水煎服后连续饮用三天，可以达到诊治疾病的效果。
对于患有大肠杆菌的患者来说，选择合适的药物才可以避免疾病的恶化。但所有服用的药物都需要在医师的真的下服用，切勿擅自服用，否则将会对自身健康造成影响。