导致晨起口干、口苦有口腔局部的问题，也可能是由于消化系统疾病引起。如果嘴里多个牙齿有蛀牙、牙周炎、牙髓炎、根尖周炎、智齿冠周炎，或者大面积的黏膜溃疡，这些疾病会导致口内致病细菌增多，引起晨起口苦。由于唾液腺功能受损，使唾液分泌量下降，也会引起口干、口苦，最典型的是口腔黏膜干燥综合征的患者，该病多见于中老年女性，晨起口腔极度干燥，味觉功能出现障碍，引起口苦。导致晨起口干、口苦的消化系统疾病主要有胆石症、胆汁淤积症、胆汁反流症、慢性胆囊炎等，由于胆汁会反流到口腔内，并且有消化不良的现象，会引起晨起口干、口苦的症状。