海马多鞭丸的主要功效是提高性功能，临床主要用于性功能障碍及遗精。海马多鞭丸具有补肾壮阳、填精益髓的作用，对于肾阳不足所致的性功能障碍具有较好的治疗作用，可以改善面色无华、头晕目眩、腰膝酸软、形寒肢冷、小便清长、大便不实、舌淡苔白、脉沉细弱等症状。
海马多鞭丸具有补肾壮阳的作用，对于肾阳不足、肾气不固所致的遗精具有较好的治疗作用，可以改善面色无华、头晕目眩、腰膝酸软、神疲无力、舌淡苔白、脉沉细弱等症状。临床主要用于气血两亏、面黄肌瘦、梦遗滑精、早泄、阳痿不举、腰腿酸痛。而对于湿热、阳虚火旺所致的阳痿、遗精者要慎用。服药期间要忌食一些生冷、油腻的食物，要慎房事。