卵巢囊肿在临床上不可以穿刺手术治疗。因为一旦穿刺，如果卵巢囊肿是巧克力囊肿，很可能会使病情加重。如果是其他性质的囊肿，在没有明确诊断之前做穿刺，一旦具有恶性成分，也会使肿瘤进一步扩散。
所以卵巢囊肿如果直径大于5cm，一定给予手术治疗，可以选择开腹手术，也可以选择腹腔镜手术，而卵巢囊肿一旦是恶性肿瘤的情况下，手术的方式也会有所改变。所以卵巢囊肿千万不要盲目的穿刺，很可能会造成非常严重的后果，给今后治疗带来很大的麻烦。