女性小腹阵痛的主要原因有以下两大类：
1、消化道的相关疾病，如胃肠道的炎症、肠道的息肉、肠道的炎性相关疾病，如克隆氏病、溃疡性结肠炎以及肠道的肿瘤等。
对于此类疾病，可表现为腹部阵发性的隐痛或绞痛，伴有恶心、呕吐以及腹泻、大便性状的改变，如大便次数增多或大便变细、变稀、不成形，以及大便带血或带有黏液，可通过腹部CT或胃镜、肠镜检查明确。
2、妇科的相关疾病，常见的主要有子宫肌瘤、卵巢炎，以及输卵管炎、盆腔炎、卵巢囊肿等疾病，除腹部的隐痛外，还可表现为月经不规律或月经量增多，可通过妇科的相关检查明确。
3、泌尿系感染和炎症也会导致小腹疼痛。