腘窝囊肿是膝关节关节液通过后方的关节囊薄弱区渗透到腘窝内的囊性肿物，经常肿物长的比较大，走路会引起酸痛感，手术治疗方法有两种：一种是传统的切开手术。
另一种是微创的关节镜手术。切开手术患者需俯卧位，膝关节后方腘窝区横行切口在肌肉间隙找到囊肿，并找到囊肿与关节腔相通的部位，将囊肿完整切除后对关节囊的缺损进行加强缝合，伤口要放引流管，避免出现血肿。
关节镜手术往往是通过膝关节腔进入到膝关节内侧间室的后方，找到关节囊的薄弱区，将薄弱区开大与囊肿相通，成为内引流手术，囊肿与关节腔开放之后，肿物就会逐渐缩小直至消失。