益生菌是药，但是副作用很少。益生菌是人体肠道中有益的菌群，人体肠道中有成千上万种细菌，分为有害菌及有益菌，二者存在一种动态平衡。
如果在某些条件下致使有益菌减少，有害菌增加，就会导致疾病产生，如腹泻、腹胀、便血等等。
补充有益菌可以压抑有害菌生长，重新调整肠道菌群，可以用于治疗便秘、腹泻等胃肠功能紊乱性疾病。
益生菌副作用很少，因此不必过于担心，可以长期服用，有的益生菌需要放在冰箱中，如乳酸杆菌，有的益生菌耐热，可以常温放置，所以可以根据个人情况选择不同的药。