紧急避孕药含有大量的孕激素，对月经的影响是比较明显的。既有可能影响月经周期，也可能影响月经经期或者是月经量。
具体的影响在不同的个体之间并不完全相同，与个体对药物的反应性有关，也与服用药物时处于月经周期的时间段有关。可能使月经期提前，也有可能使月经周期推后。有可能使月经量明显的多于平时的月经量，也有可能使月经量减少。
为了避免紧急避孕药对于女性月经的影响，原则上来说，性生活时尽量采取屏障避孕措施避孕。避孕失败或者是没有采取避孕措施，需要服用紧急避孕药时，两次服药之间的时间间隔不能少于三个月，一年之内服用次数最多不能超过三次。