扁桃体癌的早期症状常不明显，常和咽炎及扁桃体炎类似，出现咽部异物感和轻微的疼痛，随着疾病的进展，出现疼痛加重，严重时出现吞咽疼痛，并放射至同侧耳部或面部，出现口腔异味、张口受限和张口疼痛等症状。如果进一步发展，也会出现咽部吞咽障碍，或呼吸受阻。早期的扁桃体肿瘤也会出现淋巴结肿大，同侧或双侧的淋巴结肿大或变硬。