肛周脓肿一次性根治术是指在肛周脓肿切开引流后，找到内口进行挂线，避免形成肛瘘二次手术。手术可以在局麻或者蛛网膜下腔阻滞麻醉，或者是骶麻下进行，术区皮肤碘酒、酒精消毒，肛管内碘伏消毒，于脓肿波动最明显处试穿，抽出脓液后切开引流，切口要足够长度，避免术后引流不畅。
放出脓液后脓腔内应用双氧水、甲硝唑注射液冲洗，应用探针寻找到内口，连同括约肌挂线使脓肿完全敞开，引流通畅。检查创面及脓腔无活动性出血，再次应用0.9%氯化钠注射液冲洗脓腔，擦拭干净后放置引流。肛门内放置排气管，无菌敷料覆盖，术后第一天开始换药，促进愈合。