做胃镜最好挂消化内科，很多内外科医生都可以开具胃镜检查的申请单，但是从患者病情判断及后续的治疗等角度看，最好挂消化内科。一般行胃镜检查的患者包括两类人群，常规体检约占门诊就诊的一少部分，大多数患者是因为有消化道不适症状而就诊，如反酸、嗳气、恶心、呕吐、腹胀、腹痛、消化不良，甚至呕血、黑便。
胃镜检查前，医生要根据患者的年龄、体质，以及心、脑、肺等重要脏器的功能，全面评估胃镜对患者的耐受性，尤其是无痛胃镜，要请麻醉师进行麻醉前评估。检查后根据结果，消化科医生会结合患者的症状、体征，给予精准的个体化治疗方案，其他科室的医生就很难做到全面评估和治疗的效果。