引起新生儿血小板减少的原因很多，具体如下：
1、常见的原因是新生儿感染，尤其是严重的细菌感染或者病毒感染，可以导致骨髓抑制，从而引起新生儿血小板减低，尤其是巨细胞病毒，或者人类微小病毒B19感染，均可以导致新生儿严重的持续时间较长的血小板降低，新生儿在发生重症感染的时候，凝血功能异常，消耗了大量的血小板，而导致血小板的减少。
2、有一些染色体基因病，如21三体综合征、18三体综合征等，也可以导致新生儿血小板减少。
3、少见的原因是新生儿血液系统的疾病，如继发性或者是特发性的新生儿血小板减少。
总之，引起新生儿血小板减少的原因比较多，血小板减少只是一个症状，但不能代表原发病，所以一定要寻找引起血小板减少的原发病，并做积极的治疗。