根管治疗完成两年以后发生咬合痛，可能的原因有牙根的横折或者纵裂，也有可能是由于根管治疗失败所引起：
第一、根管治疗完成以后，实际上牙齿已经失去了牙髓神经的营养。它本身就比较脆弱，所以在经受了咬合压力以后，有可能发生牙根的横折或者是纵裂。发生牙根横着或者纵裂，都可以表现为根管治疗完成以后，牙齿发生咬合痛。
第二、根管治疗实际上有一定的成功率，如果由于局部根管内的细菌比较顽固，疗效也会比较低，就会发生根管治疗以后的失败。表现为根管治疗完成以后，根尖区的牙槽骨吸收，发生牙齿的咬合痛。
当发生根管治疗以后咬合痛，首选去拍牙片，看一下是不是牙根、牙冠出现裂纹，或者出现了根管治疗的失败。根据不同的诊断，再采取相应的措施。