大多数上呼吸道感染都是病毒所引起，病毒要占到85%以上，甚至90%，所以对于上呼吸道感染其实不需要用什么药。病毒感染引起的上呼吸道感染有自限性，患者会自愈，一般5-7天就可以自愈。患者用的药可能是一些退烧药，因为小孩子出现上呼吸道感染可能表现发烧，有感染就会有发烧。发烧的时候可以用药，比如可以用布洛芬、对乙酰氨基酚进行口服退烧药，这是指南中所推荐。其他的药应该就不必要用了，发烧用药也建议在38.5℃以上时，有些孩子因为发烧很难受，即便没有到达38.5℃，现在指南也推荐可以用，主要的目的就是改善孩子的舒适度。
除此以外，比如细菌感染引起的上呼吸道感染可以用抗生素，一般是社区获得性感染，可以用β-内酰胺类抗生素，比如青霉素类、头孢霉素类药物都可以使用。也有些患者是支原体感染，支原体感染引起上呼吸道感染也有可能，就用大环内酯类抗生素，比如阿奇霉素、红霉素等等都可以使用。