新生儿做CT没有特别的影响的情况，如果怀疑有高度的脑部的出血，要给新生儿做头颅的CT。在给新生儿做头颅CT的时候，由于做的次数非常的少，只是偶尔做一次，对新生儿的危害是非常小的，可以忽略不计。因为人体的组织对于辐射具有一定的耐受性，并且新生儿的血液循环是非常顺畅的，从而代谢也会快些。
还会引起新生儿出现病理性的损伤，如果新生儿做CT的次数非常多，会导致辐射量对身体的组织危害比较大，从而引起新生儿出现白血病的增加，引起出现肿瘤的可能性加大，都是不良的情况。所以新生儿能够不做CT时就尽量不做。