化脓性骨髓炎属于骨骼系统感染，一般分为急性和慢性两种。如果是急性化脓性骨髓炎，早期可以选择抗生素保守治疗，主要用药方案为联合大剂量使用。
可以选择一种针对革兰氏阳性菌的抗生素，比如酶抑制剂的美洛西林舒巴坦钠，然后再加一种广谱的抗生素，比如喹诺酮类的左氧氟沙星注射液治疗。
同时局部可以分层穿刺抽脓液做细菌培养和药物敏感试验，根据药物敏感试验再选择相应的抗生素。
如果是慢性骨髓炎反复的发作，尤其是伴随死骨形成或者窦道，需要考虑手术治疗，手术彻底清理干净局部坏死骨及脓液，然后可以选择万古霉素骨水泥填充抗感染治疗。