胃蛋白酶原分为胃蛋白酶原1和胃蛋白酶原2两个亚型。胃蛋白酶原1是由胃底腺的主细胞和颈黏液细胞分泌产生，可以反映胃泌酸细胞功能。其增多，见于胃酸分泌增多；其减少，见于胃酸分泌减少或者胃黏膜腺体萎缩。胃蛋白酶原2可以由胃底腺、颈黏液细胞、胃窦黏膜腺体、十二指肠布什腺腺体等多种腺体分泌，在血液中维持相对稳定的水平。胃蛋白酶原2升高表现于胃底腺腺管萎缩、胃上皮化生等；胃蛋白酶原2减低，没有很明确的临床意义。胃蛋白酶原2升高，需要定期来做胃镜检查，明确有没有胃的黏膜萎缩、胃上皮化生等癌前病变的情况。