月经干净后总是肚子疼，这可能有妇科炎症的情况存在。类似可能有阴道炎、宫颈炎、附件炎、盆腔炎或卵巢囊肿之类。有可能跟在月经期人比较劳累、熬夜，饮食不当，如吃生冷的、辛辣的、刺激性的食物或喝酒、吃火锅、烧烤就会导致月经干净后出现肚子疼。在月经期过性生活容易导致细菌侵入，导致炎症发生，那可能会导致后期肚子疼的情况存在。这种情况可以去医院做妇科常规检查和盆腔B超检查，观察一下，如果有炎症，就需要采取药物来进行消炎治疗。常用的药物有甲硝唑、左氧氟沙星或头孢克肟等进行对症消炎治疗。同时饮食方面要清淡，避免生冷、辛辣、刺激性食物的摄入，热敷小肚子注意休息，避免劳累、熬夜，这段时间禁止性生活。