食管癌病人合并头疼，可能是出现了食管癌脑部的转移。当脑部的病灶比较大，会对脑组织重要的功能区域进行压迫和破坏，出现脑水肿的表现，病人可以出现头疼、头晕、恶心、喷射性呕吐等症状。
有一些食管癌到了晚期，由于长期进食减少，呈消耗性的体质。对于合并有高血压、心脏病的患者，可以造成血压波动、心肌缺血，这些都可能导致食管癌病人出现头疼的症状。此外，晚期食管癌病人，由于癌症所造成的痛苦常常会出现失眠的现象，而头疼是长期失眠合并的症状之一。