一般来说甲胎蛋白的下降，并没有明显的规律。在肝癌治疗前，甲胎蛋白可以明显地增高，当使用手术、靶向治疗、免疫治疗等治疗手段，获得疗效后，甲胎蛋白会逐渐下降。如果治疗疗效比较好，甲胎蛋白下降的速度可能会很快，病人在复查甲胎蛋白时，就会发现甲胎蛋白在治疗1-2个月的时间，就可以下降到正常的水平。
有的病人对相应的抗癌治疗，并不是特别敏感，肝癌细胞就不能获得大量的杀死，这时甲胎蛋白下降的速率就会变慢，甲胎蛋白会出现逐渐下降的情况，当肝癌出现复发、进展的时候，甲胎蛋白的数值会再次地明显升高，这也是帮助临床医生，早期发现病人复发和进展的重要的指标。所以原发性肝癌的病人在治疗之前、治疗中以及治疗后，至少每三个月，应该定期复查甲胎蛋白指标的变化。