打喷嚏的原因是鼻子或者咽喉表层黏膜，受到内在或者外在刺激而引起的反射性反应，很多因素都可能会引发喷嚏的症状出现。
首先，感染性病症，因为鼻腔或者咽喉组织出现感染性病症后，鼻腔或者咽喉黏膜组织受到炎症的刺激，会出现表层毛细血管充血性肿胀以及分泌液持续渗出，机体为了能排出分泌物而出现打喷嚏的生理性反应。
其次，过敏因素，如灰尘、花粉、空气污染物等，鼻腔或者咽喉内壁组织接触过敏原的刺激后，机体出于保护机制而出现防御性反应，引起打喷嚏现象出现。鼻腔息肉、鼻窦癌、鼻中隔偏曲、外界刺激等原因，都可能会引起打喷嚏的症状出现。