制霉菌素片主要用于消化道的霉菌感染，如果妇科上出现霉菌感染，主要见于外阴阴道假丝酵母菌病。临床上的治疗是外用药物治疗，需要改变阴道内的酸碱度，用碳酸氢钠给予冲洗。另外在阴道局部可以塞入制霉菌素栓进行治疗，可以达到非常好的效果，绝大部分女性不用口服药物治疗。
对于妇科的念珠菌感染，建议一定要在治疗后通过实验室检查，连续3次都转为阴性后才可以停止用药。念珠菌通过性接触可以传染，所以在实验室检查没有转为阴性前不可以有性生活。