心肌炎的化验室检查主要进行血常规、炎症反应标志物、C反应蛋白以及心肌酶的化验检查。心肌炎多由病毒感染引起，因此血常规可以帮助判断有无病毒感染的存在，同时在感染的炎症状态下，C反应蛋白指标会明显的升高。
心肌炎的患者心肌细胞因为发生了炎症，而导致细胞的破坏，释放心肌酶，因此心肌酶的水平会有升高。此外，心肌炎的患者如果合并了心功能的衰竭，通过测定血浆脑钠肽水平，可以帮助了解有无心功能衰竭的存在，以及判断心功能衰竭的进展情况。