单纯的肾结石不会发生尿毒症，而导致尿毒症的肾结石，是由于肾结石引起的复杂性尿路感染，反复多次的发作，长期的反复使用抗生素而引起的肾脏的功能损伤。由于结石引起梗阻，导致尿流的引流不畅，出现梗阻性肾病，长此下去会引起肾功能衰竭、尿毒症的发生。
肾结石引发的尿毒症也有部分是由于碎石，导致肾脏血肿形成，或者其他的副损伤而引起的肾功能的下降，对于肾结石也需要多喝水、多排尿，防止结石的逐渐增大，一旦梗阻需要及时的解除，以防尿毒症的发生。