正常精液的颜色是灰白色，液化后为半透明的乳白色。如果病人长久不射精，偶尔会发现精液有淡黄色。如果病人出现黄绿色精液，常常提示有淋球菌或金黄色葡萄球菌感染，常常由于淋菌性尿道炎引起精液发黄。
如果精液颜色呈红色，常常提示有急性精囊炎，急性精囊炎常由于溶血性葡萄球菌或大肠埃希氏杆菌感染引起，会使精液呈现出鲜红色、淡红色或暗红色。
如果血精量较大，还要小心有无精囊肿瘤的可能。精囊肿瘤发病率较低，临床上罕见。